反向互补序列软件(反向互补序列)
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1、一、顺序不同:原序列:AATTCCGG,则反向序列为:GGCCTTAA 就是原序列反过来;互补序列:TTAAGGCC 就是与原序列互补;反向互补:CCGGAATT 就是与反向序列互补。
2、二、概念不同:互补的概念就是A-T,C--G配对要将核苷酸序列转换成反向互补序列,需要用DNASTAR软件,其中有EditSeq组件。
3、三、序列编码不同:在用DNAMAN的多序列比对时,包括编码链和非编码连的比对,测序得到的目的片段可能是非编码链(即目的基因的编码链的互补序列),而NCBI中提交的序列都是编码链的序列。
4、#!usr/bin/perl/-wprint "put in";$a=
5、适用于基因游走、转位因子和已知序列DNA旁侧病毒整合位点分析等研究。
6、用传统的缓冲液和其他提供者推荐的条件裂解DNA。
7、反向PCR所扩增的片段的大小由 PCR扩增片段的大小决定,PCR扩增的实际上限为3-4kb。
8、能裂解核心区的内切酶使反向PCR只能扩增引物所定模板(依赖于引物)的上游 或上游区,而不裂解核心区的酶则使两上边侧序列都扩增,并带有由内切酶和环化类 型决定的接点(例如,互补突头连接与钝头连接)。
9、参考资料来源:百度百科-反向PCR。
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